Após a desistência do Colo-Colo, que foi substituído pelo São Francisco, mais um clube deixará de disputar a Copa São Paulo 2012. Desta vez, o Atlético de Roraima não enviou a relação de atletas para a Federação Paulista de Futebol (FPF), organizadora da competição, e foi excluído do torneio.
 

O time roraimense estava no grupo J, ao lado de Red Bull Brasil, Portuguesa e Vitória. Em seu lugar entrou o Sertãozinho (SP).
 
O confronto entre o rubro-negro e o clube paulista será no dia 4 de janeiro, em Campo Limpo (SP). Em seguida, o Leão enfrenta a Lusa (08/01) e o Red Bull (11/01).